第一阶段——吸胀吸水期：此阶段主要依赖种子内胶体成分吸收水分，是原来的凝胶状态的物质转变为溶胶状态的物质，此时诸多大分子的链得以舒展，种子细胞恢复原有的结构和功能。值得指出的是，此时期的吸水与种子是否有活性无关，也就是说死种子也可以经历吸胀吸水期，表现为种子膨大。

第二阶段——缓慢吸水期：经过了第一期的吸水作用，种子原生质体的水合程度已经趋于饱和；细胞膨压增加和种皮的限制，阻碍了进一步吸水。此时种子吸水呈现由快吸水转向慢吸水阶段，此时种子细胞内多种酶蛋白恢复活性，休眠的DNA恢复活性，开始转录信使RNA。同时启动大量酶促反应，表达多种蛋白。与此同时，种胚细胞开始合成、分泌赤霉素（GA），促进胚乳的分解，以提供胚细胞生化反应的原料。由于大量的胚乳分解物质进入胚细胞内，胚细胞内液渗透压上升，又加快了吸水，所以细胞进入萌发第三期。

第三阶段——生长吸水期：由于细胞代谢的加快和胚细胞渗透压上升，导致吸水速度由第二期的慢吸水进行性加快。此时，胚根、胚芽中的核酸、蛋白质等生命物质代谢旺盛，胚细胞的生长引起了种皮外观的可见萌动。当胚根突破种皮后，有氧呼吸加强，新生器官生长迅速，表现为种子渗透吸水和鲜重的持续增加。

在整个萌发过程中，有许多机制在调节，目前认为是赤霉素水平在起主要作用：在萌发第二期，胚细胞开始分泌赤霉素，它促进了胚乳的分解，并转运到胚细胞内。这时胚乳就好像一个营养“源”，分解后的小分子物质转运到胚细胞细胞质内形成“库“，进而提供原料给诸多的生化反应利用。“源“内物质的分解决定“库“内小分子物质的量；“库“内贮存物质的量又影响赤霉素的合成，反作用于“源“内物质的分解。“源“与“库“相互影响，相互协同，保证了营养物质有效的被细胞所利用，这个就是著名的“源——库“理论。该理论对胚乳的生物学利用和种子引发了有重要的指导意义。

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